Родился в 1961 г. В 1985 г. окончил факультет подготовки врачей для Военно­-воздушных сил ВМедА им. С.М. Кирова. В течение последующих 4 лет проходил службу в должности врача части и начальника медицинской службы авиационного полка. С 1989 по 1992 г. — клинический ординатор при кафедре рентгенологии и радиологии ВМедА им. С.М. Кирова.

После окончания клинической ординатуры занимал должности старшего ординатора и начальника рентгеновского кабинета клиники нейрохирургии с 1992 по 1996 г.

В 1993 г. защитил кандидатскую диссертацию «Комплексная лучевая диагностика объемных патологических образований глаза и глазницы», в которой разработал методику и внедрил в клиническую практику МРТ при обследовании органа зрения.

В 1996 г. назначен на должность преподавателя, а в 1999 г. — доцента кафедры рентгенологии и радиологии. С 2001 по 2003 г. — заместитель начальника, а с 2003 по 2011 г. — начальник кафедры рентгенологии и радиологии — Главный рентгенолог МО РФ.

В 2000 г. защитил докторскую диссертацию на тему «Магнитно­-резонансная и рентгеновская компьютерная томография в комплексной лучевой диагностике объемных патологических образований задней черепной ямки и основания черепа». В диссертации были решены основные проблемы лучевой диагностики новообразований задней черепной ямки и основания черепа с использованием современных методов нейровизуализации. В 2000 г. присвоено ученое звание профессора.

В 2011 г. в связи с организационно-­штатными мероприятиями (переходом кафедры в ранг гражданского подразделения академии) по конкурсу выбран на должность заведующего кафедрой рентгенологии и радиологии с курсом ультразвуковой диагностики Военно-­медицинской академии им. С. М. Кирова. В 2014 г. также в связи с оргштатными мероприятиями (введение военной должности начальника кафедры) переведен на должность профессора кафедры.

Более 11 лет Труфанов Г.Е. руководил старейшей кафедрой рентгенологии и радиологии страны. Геннадий Евгеньевич не только сохранил ее богатейший учебно­-методический и научный потенциал, созданный такими видными учеными, как Н.А. Орлов, М.И. Неменов, Г.А. Зедгенидзе, Л.Д. Линденбратен, А.Н. Кишковский, но и приумножил опыт своих предшественников, развил новые направления учебной, научной и клинической деятельности. Его ученики успешно развивают созданные им научные направления; возглавляют научные подразделения и лечебные учреждения Министерства обороны и Министерства здравоохранения Российской Федерации.

С 2015 г. по настоящее время — заведующий научно-­исследовательским отделом лучевой диагностики и кафедрой лучевой диагностики и медицинской визуализации с клиникой ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр им. В.А. Алмазова» Минздрава России.

В 2024 г. присвоено звание «Заслуженный деятель наук Российской Федерации».

Основные направления научно­-педагогической и клинической деятельности: организация учебно-­научной и клинической деятельности, разработка вопросов организации и проведения лучевых методов исследования при неотложных состояниях, а также при обследовании больных неврологического и нейрохирургического профиля. Внедрение в практику новых перспективных диагностических методик магнитно-­резонансной и рентгеновской компьютерной томографии в нейровизуализации; инновационных технологий исследования нейронных сетей головного мозга (совм. с Ефимцевым А.Ю.); рентгенодиагностических комплексов для неонатологии и педиатрии (совм. с Алхазишвили А.А., Потраховым Н.Н.); МРТ в акушерстве и гинекологии (совм. с Мащенко И.А.); разработка и внедрение в клиническую практику методики МР­-гистеросальпингографии при бесплодии (совм. с Сергиеня О.В.), функциональной МРТ в диагностике нарушений менструального цикла у девочек (совм. с Штенцель Р.Э.).

Труфанов Г.Е. является руководителем государственных заданий:
2018–2020 гг. «Разработка и внедрение новой методики магнитно­-резонансной гистеросальпингографии при бесплодии».
2018–2020 гг. «Инновационный цифровой рентгенодиагностический комплекс для неонатологии и педиатрии».
2018–2020 гг. «Разработка и внедрение нового метода неинвазивного определения содержания железа в печени и миокарде по данным магнитно-резонансной Т2*­релаксометрии для оценки эффективности терапии хелаторами железа и планирования трансплантации костного мозга».
2021–2023 гг. «Разработка новой технологии диагностики нейро-дегенерации и количественной оценки нейропластичности при прогрессирующих типах рассеянного склероза с использованием биомаркеров на основе исследования морфометрических параметров мозга и коннектома».
2023–2026 гг. «Разработка системы нейросетевого моделирования для магнитно-­резонансной пельвио­ и фетометрии для определения рисков затрудненных родов»

Под научным руководством и консультировании Геннадия Евгеньевича защищены 12 докторских и 52 кандидатских диссертаций. Автор и соавтор более 900 публикаций, в том числе 14 монографий, 3 учебника, 28 учебных пособий, 8 методических указаний и рекомендаций и более 70 руководств для врачей, а также 5 патентов на изобретения и 50 рационализаторских предложений.

Труфанов Г.Е. является членом двух диссертационных советов по присуждению ученых степеней кандидата и доктора медицинских наук.

Награжден медалью Немёнова М.И.

Индекс Хирша (РИНЦ) — 22.

Индекс Хирша (Scopus) — 6.

Заведующий научно-исследовательским отделом лучевой диагностики,

заведующий кафедрой лучевой диагностики и медицинской визуализации с клиникой,

д.м.н., профессор